Mit wem ziehst du ins Abenteuer? Diese Frage können alle Spielerinnen und Spieler von Miitopia ganz individuell beantworten: Sie entscheiden, wer in dieser Geschichte die Hauptrollen spielt. Dafür erstellen sie Mii-Charaktere, etwa von ihren Freundinnen und Freunden. Gemeinsam brechen sie in ein einzigartiges Abenteuer auf: Denn der dunkle Fürst hat die Gesichter der Einwohnerinnen und Einwohner des friedlichen Fantasy-Reichs Miitopia gestohlen und es liegt an ihnen, seine Pläne zu durchkreuzen.